Jako dolní část areálu zoo chápeme území, které zabírá přibližně třetinu rozlohy zoo a které se nachází mezi Vltavou a páteřní komunikací, jež vede od hlavního vchodu směrem na západ – tedy k Velké voliéře dravců a pak dál pod skalní sráz s výběhy horských kopytníků. Právě tato cesta vznikla v nově zakládané zoo jako první a na zmíněném území byla budována většina nových expozic.

Od 30. let ovšem prošla dolní část zoo mnoha proměnami. V současné době tu najdete kromě některých pavilonů také zajímavé expoziční celky (například Vodní svět a Opičí ostrovy) a především odpočinková místa. Patří k nim nejen restaurace a stánky s občerstvením, ale také Dětský areál, rezervace Bororo, pikniková místa a malá dětská hřiště.